Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FDCSPQ8NFU4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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