Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC18Q8N456 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC18Q8N456 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms