Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
YTHDF3Q7Z739 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms