Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TCF23Q7RTU1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TCF23Q7RTU1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TCF23Q7RTU1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TCF23Q7RTU1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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