Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USP43Q70EL4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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