Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LRIG3Q6UXM1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms