Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USPL1Q5W0Q7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms