Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ANKRD39Q53RE8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms