Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLHL12Q53G59 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms