Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SP6Q3SY56 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SP6Q3SY56 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SP6Q3SY56 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SP6Q3SY56 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SP6Q3SY56 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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