Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms