Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Q1T7F1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
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