Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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