Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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