Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FSCN1Q16658 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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