Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LAMA4Q16363 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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LAMA4Q16363 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LAMA4Q16363 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
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