Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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