Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRS1Q15050 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRS1Q15050 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRS1Q15050 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRS1Q15050 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRS1Q15050 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRS1Q15050 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRS1Q15050 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRS1Q15050 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms