Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms