Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNTB1Q13884 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms