Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRSQ13332 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRSQ13332 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PTPRSQ13332 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTPRSQ13332 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTPRSQ13332 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRSQ13332 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PTPRSQ13332 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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