Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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TRAF1Q13077 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAF1Q13077 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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