Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFCP2Q12800 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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