Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCAPQ12770 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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