Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLFN5Q08AF3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms