Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
FANCCQ00597 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FANCCQ00597 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms