Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVK-21P61565 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK-21P61565 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms