Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H2BFSP57053 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms