Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRPF1P55201 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms