Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFDNP55196 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFDNP55196 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFDNP55196 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFDNP55196 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms