Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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HOXA1P49639 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HOXA1P49639 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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