Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNTAP49354 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTAP49354 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms