Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTR1BP42025 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms