Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJC1P36383 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJC1P36383 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJC1P36383 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJC1P36383 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms