Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCGF2P35227 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCGF2P35227 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms