Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC8A1P32418 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC8A1P32418 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms