Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXC13P31276 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms