Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CASP1P29466 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASP1P29466 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASP1P29466 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASP1P29466 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASP1P29466 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASP1P29466 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASP1P29466 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASP1P29466 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASP1P29466 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CASP1P29466 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CASP1P29466 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CASP1P29466 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CASP1P29466 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms