Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PSMA3P25788 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PSMA3P25788 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms