Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA6P23229 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms