Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMIM10L1P0DMW3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms