Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APODP05090 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APODP05090 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
APODP05090 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APODP05090 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APODP05090 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms