Protein–RNA interactions for Protein: O95758

PTBP3, Polypyrimidine tract-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP3O95758 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTBP3O95758 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTBP3O95758 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTBP3O95758 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTBP3O95758 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTBP3O95758 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms