Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP19O94966 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP19O94966 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP19O94966 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP19O94966 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP19O94966 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms