Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARPC1BO15143 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARPC1BO15143 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms