Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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