Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN25C9JDP6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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