Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC182A6NF36 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC182A6NF36 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms