Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRRD1A4D1F6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRD1A4D1F6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms