Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SORCS3Q9UPU3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms